ברבות השנים נעשו תיקונים ושינויים בתוואי הגדר, לעיתים על ידי הגורמים האמונים על בנייתה, ולעיתים מתוקף הוראות בית המשפט העליון בשבתו כבג"צ.
אשר לשאלת מעמדה הנורמאטיבי של גדר ההפרדה, דומה כי שאלה זו, המתעוררת אגב אורחא בתיק שלפנינו הונחה זה מכבר לפתחו של בית המשפט העליון בשבתו כבג"צ (בגץ 5488/04 מועצת מקומית אלראם נ' ממשלת ישראל, 13.12.2006), וכך קובע הנשיא (בדימוס) ברק, בהתייחסו לגדר שהוקמה באיזור שכונת הדואר:
"העותרים טוענים כי ביסוד הקמת הגדר בעוטף ירושלים, ובאזור א-ראם בפרט, עומד שיקול מדיני, אותו המפקד הצבאי אינו מוסמך לשקול. לא שוכנענו בצדקתה של טענה זו. מתוך הנתונים שהובאו בפנינו, אין אנו מוצאים סיבה להניח כי מטרת הגדר הנה פוליטית ולא בטחונית. בדומה למסקנותינו בפרשות בית סוריק, אלפי מנשה, ואריאל (בג"ץ 1348/05 ראש עריית סלפית נ' מדינת ישראל (טרם פורסם)), אף כאן מצאנו כי התכנית להקמת הגדר בעוטף ירושלים התקבלה לאור מציאות הטרור הקשה הפוקדת את ישראל מאז ספטמבר 2000. ישראל סובלת בשנים האחרונות ממתקפת טירור רצחנית, קשה וכואבת. מתקפת הטרור נמשכת גם בימים אלה. אחד מ"שערי הכניסה" לישראל בו משתמשים הטרוריסטים היא ירושלים.
...
להסרת ספק אדגיש, כי אין בקבלת תביעת המערערים לאי שלילת מעמדם כ"תושב" משום ייחוס משמעות מדינית לגדר ההפרדה, בניגוד לפסיקתו של בית המשפט העליון, וכמובהר החלטתי מתייחסת למערערים ונסיבותיהם, אשר אחת מהן היא מגורים בצדה המערבי של הגדר, עת לדעתי בקביעה אם יש מקום לשלול את התושבות מהמערערים שעברו להתגורר בשטח המיוחד, אין להתעלם מהשלכות בניית גדר ההפרדה.
סוף דבר: בשל מכלול הנסיבות הקונקרטיות במקרה הנדון: היותם של המערערים תושבי ירושלים ובעלי מעמד של תושב במשך שנים על המשמעות הנגזרת מכך; היותם של המערערים בעלי רישיון לישיבת קבע ונושאים תעודות זהות ישראליות; הזיקות המשמעותיות המצביעות על כך שמרכז חייהם של המערערים הוא בירושלים; מגוריהם של המערערים בצד המערבי של גדר ההפרדה על ההשלכות הנובעות מכך - אין לשלול מהם את מעמד התושבות רק נוכח העתקת המגורים לשטח המיוחד בשכונת הדואר, מעבר לקו המוניציפאלי של ירושלים.
סוף דבר
על דעת רוב חברי המותב – הנשיא (בדימוס) יגאל פליטמן, הנשיאה ורדה וירט-ליבנה ונציג ציבור (מעסיקים) מר דן בן חיים, וכנגד דעתם החולקת של השופטת לאה גליקסמן ונציג ציבור (עובדים) מר אמיר ירון - הערעור נדחה מהטעמים המפורטים בחוות דעתה של הנשיאה ורדה וירט-ליבנה.