בהמשך קבע בית-הדין כי משנרשמו המערערים במירשם האוכלוסין של האיזור, ומכוחו קיבלו תעודות זהות של האיזור מבלי שפנו במהלך עשרות שנים למשרד הפנים, ומשנקבע בהחלטת הממשלה כי לא יינתנו רישיונות ישיבה למי שטען שמרכז חייו היה בירושלים המזרחית עובר לחודש יוני 1967 למרות שלא התפקד אותה עת בשנת 1967 כתושב ירושלים המזרחית – הרי ש"האפשרות לקבל תושבות קבע מוצתה זה מכבר וכיום מדינת ישראל אינה מחויבת להעניק רישיון זה על בסיס טענות של מרכז חיים בירושלים מאז 1967".
בהמשך פסק-הדין חזר בית-הדין וציין, כי העותרים לא הגישו את הבקשה במועד הקובע להגשת הבקשות (30.4.08) ומשכך רואים אותם כמי שויתרו בפועל על קבלת מעמד קבע בישראל.
המערערים גורסים, כי החלטת הממשלה, ככל שהיא מתייחסת ל"בקשות 1967", לא רק שאינה קובעת מועד להגשת הבקשות, אלא אף אינה מבחינה בין בקשות שכבר הוגשו למשיב לבין בקשות עתידיות; זאת כאשר לכאורה אותה מיגבלה חלה גם על בקשות שכבר הוגשו למשיב, אך טרם נדונו על-ידו. לטענת המערערים, המשיב עצמו לא פעל על-פי החלטת הממשלה, כאשר העניק לאחר מועד ההחלטה האמורה רישיונות לישיבת אירעי ולישיבת קבע למי שרשומים במירשם האיזור, אשר הוכיחו מרכז חיים בישראל למן שנת 1967 או 1972 לפי העניין, ובכללם כמה עשרות תושבים משכונת עין ג'ויזה, שהִנם שכניהם של המערערים. לשיטתם, משהמשיב עצמו לא פעל על-פי החלטת הממשלה, הוא מנוע מלהסתמך עליה לביסוס סרובו לקבל את הבקשות כאמור. בנוסף טוענים המערערים, כי החלטת הממשלה נגועה בחוסר סבירות קצוני שכן היא ביטלה את זכותם הטבעית "לתקן עוות שנכפה עליהם" על-ידי פוקדים מטעם המדינה, אשר לא ידעו לזהות, או לאתר, את מקום מגוריהם בתחום ישראל.
לא מצאתי מקום לאפשר למערערים לתקן את הודעת העירעור, ולטעון במסגרת הפגמים שנפלו בהחלטת המשיב, כי המשיב היה אמור לבחון לחלופין לאשר למערערים, או למי מהם, גם המשך שהייה במזרח ירושלים על-פי היתרים שיינתנו על-ידי מפקד כוחות צה"ל באיו"ש, על-בסיס "הסדר 1972", שעל-פי טענת המערערים לא בוטל במסגרת סעיף א' להחלטת הממשלה 2492 – שכן סעיף א' היתייחס רק לקבלת רישיון לישיבה בישראל לפי חוק הכניסה לישראל, וסעיף ב' היתייחס רק למקרה ספציפי שבו גדר הבטחון פגעה ביכולת של המבקש, שהוא תושב איו"ש, לקיים קשר עם שטחי איו"ש. לא נעתרתי לבקשה, הואיל ובקשותיהם של כל המערערים, אשר הוגשו למשיב, היו לקבלת מעמד לפי חוק הכניסה לישראל – אשרה לישיבת קבע, ולא בקשה לקבלת אישור שהייה על-פי היתרים מהמפקד הצבאי במסגרת "הסדר 1972", והבקשה החלופית לקבלת אישור שהייה על-פי היתרים מהמפקד הצבאי, לא הועלתה בערר שהוגש לבית-הדין לעררים, וממילא לא נדונה ולא הוכרעה.
...
כל הבקשות שהגישו המערערים נדחו על הסף בהחלטות המשיב שבהן צוין, כי הבקשות לקבלת רישיון ישיבת קבע נדחות, הואיל "ובהתאם להחלטת הממשלה 2492 מיום 28.10.07 לא ניתן להגיש יותר בקשות למעמד מכוח רצף מגורים משנת 1967". עררים פנימיים שהגישו המערערים למשיב נדחו על-ידי המשיב; ולפיכך הגישו המערערים עררים לבית הדין לעררים.
בפסק-דינו קבע בית-הדין, כי דין העררים להידחות, זאת מן הטעם "שהחלטת הממשלה קבעה מגבלת זמן להגשת הבקשות, בה העוררים לא עמדו". יוער, כי בעניין זה שגה בית-הדין, שכן החלטת הממשלה קבעה מגבלת זמן להגשת בקשות בעילה של שהייה בישראל משנת 1987 ואילך, כאשר בניית גדר הביטחון באזור ירושלים, פגעה באופן ממשי במרקם חייו של מבקש המעמד, במובן של מניעה או הכבדה קשה לקיים קשר עם שטחי איו"ש; זאת שעה שהמערערים לא הגישו בקשה לקבלת מעמד בשל שהייה בישראל משנת 1987 והכבדה שיוצרת גדר הביטחון, אלא בקשה לקבלת מעמד נוכח שהייה בירושלים ברצף משנת 1967.
בנוסף מדגישים הם, כי "הסדר 1987" בחלקו השני, שאִפשר הגשת בקשות בתקופת ביניים בזיקה לגדר ההפרדה, לא יכול היה להועיל להם, שכן אין ליד בתיהם גדר הפרדה המכבידה על מעברם לאיו"ש.
תמצית טיעוני המשיב
המשיב טוען, כי דין הערעור להידחות, הואיל ועל-פי החלטת הממשלה לא ניתן עוד להגיש בקשות למעמד מכוח טענה לרצף מגורים בירושלים עובר לשנת 1967; ומכל מקום נוכח עשרות השנים שחלפו קיים קושי רב בבחינת בקשות לקבלת מעמד מכוח טענת רצף מגורים מאז שנת 1967.