לגופה של החלטת צוות ההכרעה נטען, בין היתר, כי הצוות לא הכריע, באופן חד משמעי, במחלוקת בין הצדדים, היינו - בשאלה אם ההכנסות מהשטחים הלבנים הן הכנסות המשיבה או חנ"י ואף לא נימק, כראוי, את קביעתו לפיה התמלוגים המוטלים על חנ"י, מהוים הוצאה בייצור הכנסה.
כך, למשל, בבג"ץ 991/91 דוד פסטרנק בע"מ נ' שר הבינוי והשיכון, פד"י מה(5) 50) (2.9.1991) אליו הפניתה המשיבה בטיעוניה, שינה בג"ץ את המצב הקיים עד אז, בו סכסוכים בעינייני מכרזים נדונו על ידו, בנימוק לפיו הטענות המועלות בתובענות הנוגעות למכרזים "מעוגנות הלכה למעשה - בדיני החוזים הכלליים אף אם שזורים בהן טעמם העולים מן הכללים של המשפט המנהלי". גם עינייני תיכנון ובנייה הועברו באמצעות ההלכה הפסוקה, לסמכות בתי המשפט המחוזיים - בג"ץ 1921/94 סוקר נ' הועדה לבניה לבנייה למגורים ולתעשיה, מחוז ירושלים, פד"י מח(4) 237) (6.7.1884), אשר גם אליו הפניתה המשיבה.
האחרת אמרה, כי הסמכות לעולם מצוייה בידי בג"ץ והשאלה אם קיימת סמכות מקבילה נעוצה במהותו ובטיבו של הענין המנהלי הספציפי שעל הפרק (גישתו של הנשיא ברק בעיניין סוקר הנ"ל) וכי לצורך הכרעה מהו ענין המצוי בסמכות מקבילה יש לתת את הדעת למספר מאפיינים ובכללם: "קיומו של היבט אזרחי לסכסוך; קיומה של מחלוקת עובדתית המצריכה בירור עובדתי ושמיעת ראיות בערכאה דיונית; ומידת הצורך בפתוח הלכתי בנושא העומד לדיון".
בפרשת צ'רני נקבע, כאמור, כי מצב זה השתנה עם חקיקת החוק, אשר שינה באופן מהותי את תפיסת חלוקת הסמכויות בעניינים מנהליים בין ערכאות השיפוט השונות, שכן כעת מוסדר הנושא בחקיקה מפורטת.
נפסק, כי שיקול דעת זה של בג"ץ "... מובנה בסמכותו של בג"צ ונגזר מהמעמד החוקתי שניתן לסמכות זו בחוק יסוד: השפיטה, ויש לו שורשים הסטוריים במהותם של הצוים הפררוגטיביים שהוא מוסמך להעניקם (פרשת פסטרנק, 59-58). הסמכות להעניק צוים אלה כללה מאז ומעולם סמכות שיקול דעת לבג"צ מתי להזקק לענין שבסמכותו, ומתי להמנע מכך, וקיומו של סעד חלופי בערכאה מקבילה הוא אחד המצבים בהם עשוי בג"צ להמנע מלהכריע בעתירה מינהלית המובאת לפניו".
בצד זאת צויין, כי לאחר חקיקת החוק ונוכח הקף העניינים אותם מעביר המחוקק לסמכות בתי המשפט לעניינים מנהליים, הנותן "מענה מערכתי רחב לצורך באיזון נטלים בין הערכאות השיפוט בעניינים מנהליים" השתנה הקף שיקול הדעת הנתון לבג"ץ לסווג עניינים (שאינם נכללים בחוק) כמצויים בסמכות מקבילה.
במקרה אחר - בבג"ץ 10695/05 קבוץ משגב עם ו-62 ישובים נוספים נ' מועצת מקרקעי ישראל (16.1.2012) בו נדונה עתירה של תושבי יישובי קו העימות, בה נטען כי הם, כישובים חקלאיים, מופלים לרעה לעניין תחולתן של החלטות מועצת מקרקעי ישראל, הקובעות מדיניות של מתן פטור מלא מתשלום דמי חכירה בהקצאות חדשות של קרקע למטרות שונות, שאינן כוללות חקלאות, נהג בג"ץ אחרת, אולם נסיבותיו המיוחדות הצדיקו זאת.
...
סופו של דבר - אני קובעת, כדלקמן:
בית משפט זה אינו מוסמך לדון בתובענה, בשל היותה תובענה מינהלית, במהותה ולא תובענה אזרחית.
לפיכך, התובענה לא הוגשה כדין, לבית משפט זה, ולכן אין לבית משפט סמכות לדון בה, אף לא סמכות דיון "בגררא". משכך - לא קם "סעד חלופי" בבית משפט זה.
לעניין חלוקת הסמכות בין הערכאות - ככל שהסמכות להחליט בכך נתונה בידי בית משפט זה (כגישת כבוד הנשיאה נאור), אני קובעת כי לבית המשפט העליון בשבתו כבית משפט גבוה לצדק, קנויה סמכות עניינית ייחודית לדון בטענות נגד הכרעת הצוות.
לאור כל האמור לעיל, אני מורה על מחיקת תובענה זו על הסף, באשר בית משפט זה נעדר סמכות עניינית לדון בה.
המשיבה תשלם לכל אחת מהמבקשות 2-1 והמבקשת 3, הוצאות משפט ושכ"ט עו"ד בסך כולל של 20,000 ₪ (סה"כ: 40,000 ₪).